中國水產頻道據(jù)中國食品科技網(wǎng)消息,近日,“863”計劃“鯉魚等功能基因組資源開發(fā)及其數(shù)據(jù)庫與網(wǎng)站構建”和“鯉生長等經濟性狀的主效基因發(fā)掘及育種潛力評估”項目組對《中國科學報》透露,該課題目前已取得階段性研究成果,成功裝配獲得鯉魚基因組框架圖譜、基因組物理圖譜、高密度連鎖圖譜,并獲得鯉魚—斑馬魚比較基因組圖譜和資源數(shù)據(jù)庫。
該項目是“鯉魚基因組計劃”的階段性成果。2009年底,“鯉魚基因組計劃”由中國水產科學研究院水產生物應用基因組研究中心、黑龍江水產研究所聯(lián)合中國科學院北京基因組研究所啟動。
為基因組水平育種奠定基礎
在采訪中,中國水產科學研究院水產生物應用基因組研究中心主任、水產生物技術應用領域首席科學家孫效文表示,研究人員從基因組資源挖掘的角度做了大量工作。這些工作將為實現(xiàn)經濟性狀在基因組上的精確定位、解開鯉魚的經濟性狀(生長速度、抗病能力等)和基因的復雜關系、實現(xiàn)性狀基因定位及雜種優(yōu)勢分析、利用和育種研究提供了平臺。
目前基因測序裝配已經完成,研究成果正在逐步應用到育種當中,相關開發(fā)軟件也已被同行認可和應用。
據(jù)孫效文介紹,該成果從群體遺傳學應用角度,實現(xiàn)了基礎研究與應用研究的結合,為實現(xiàn)基因組水平的水產育種產業(yè)化奠定了基礎。
將基因和性狀關系的研究結果應用于育種研究,主要包括三個階段:一是基于親本間遺傳關系,避免近親交配為主要目標的分子水平育種;二是基于經濟性狀和基因之間相互關系,尤其是經濟性狀的數(shù)量性狀位點研究結果和功能基因組研究結果進行分子育種;三是基于全基因組信息的經濟性狀與基因相互關系的分子育種,尤其是對重要經濟性狀如品質性狀(肌間刺、氨基酸代謝等)的關鍵基因及信號通路的研究結果,以及進一步的群體基因組學研究結果。
水產生物人才匱乏亟待重視
談及中國水產行業(yè)未來的發(fā)展,孫效文說:“項目進行中遇到的主要困難就是優(yōu)秀人才的流失和缺乏,這也是目前中國與歐美發(fā)達國家研究領域的主要差別,尤其是水產行業(yè)的基因組研究和生物信息學方面的人才,目前國內仍處于極度缺乏的狀態(tài)!
美國相關研究開展較早,從事基因組研究的人才隊伍龐大,且人員流動和交流相對容易和頻繁,只要有好的研究平臺和待遇,不難吸引到優(yōu)秀的人才,而我國基因組研究人才整體匱乏,由于體制和待遇等原因,能夠分流到水產生物基因組研究領域的人才則更加稀少。
孫效文表示,中國水產生物的基因組研究也有自己的優(yōu)勢,比如中國的鯉魚養(yǎng)殖有幾千年的歷史,長期的自然分化和人工選育使得中國的鯉魚種質資源豐富度為世界之最。
中國水產業(yè)對基因組研究技術的需求度極高,尤其是淡水主要養(yǎng)殖魚類具有肌間刺、肉質等品質方面的不足,這些性狀的改良十分依賴相關的基因組研究結果。
此外,中國水產養(yǎng)殖業(yè)產量世界第一,占全世界的70%,這種巨大的市場需求也是基因組研究快速發(fā)展的重要動力。
目前,該項目正在集中力量,從基因組水平對優(yōu)良品種和優(yōu)良地理種群進行種質評估,以期在群體基因組水平上提供下一步分子育種所必需的實用性強的基因資源和標記。
同時,研究人員也在對鯉品質性狀(肌間刺、脂肪發(fā)生、氨基酸代謝與合成)的關鍵基因及信號通路進行解析與闡述,以期在基因組水平上開展鯉的經濟性狀全面家養(yǎng)化培育研究 |
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