鯉魚(yú)基因組計(jì)劃成功促進(jìn)水產(chǎn)育種產(chǎn)業(yè)化

中國(guó)水產(chǎn)頻道據(jù)科學(xué)時(shí)報(bào)消息，近日，“863”計(jì)劃“鯉魚(yú)等功能基因組資源開(kāi)發(fā)及其數(shù)據(jù)庫(kù)與網(wǎng)站構(gòu)建”和“鯉生長(zhǎng)等經(jīng)濟(jì)性狀的主效基因發(fā)掘及育種潛力評(píng)估”項(xiàng)目組對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》透露，該課題目前已取得階段性研究成果，成功裝配獲得鯉魚(yú)基因組框架圖譜、基因組物理圖譜、高密度連鎖圖譜，并獲得鯉魚(yú)—斑馬魚(yú)比較基因組圖譜和資源數(shù)據(jù)庫(kù)。

該項(xiàng)目是“鯉魚(yú)基因組計(jì)劃”的階段性成果。2009年底，“鯉魚(yú)基因組計(jì)劃”由中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)生物應(yīng)用基因組研究中心、黑龍江水產(chǎn)研究所聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所啟動(dòng)。

為基因組水平育種奠定基礎(chǔ)

在采訪中，中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)生物應(yīng)用基因組研究中心主任、水產(chǎn)生物技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域首席科學(xué)家孫效文表示，研究人員從基因組資源挖掘的角度做了大量工作。這些工作將為實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)性狀在基因組上的精確定位、解開(kāi)鯉魚(yú)的經(jīng)濟(jì)性狀（生長(zhǎng)速度、抗病能力等）和基因的復(fù)雜關(guān)系、實(shí)現(xiàn)性狀基因定位及雜種優(yōu)勢(shì)分析、利用和育種研究提供了平臺(tái)。

目前基因測(cè)序裝配已經(jīng)完成，研究成果正在逐步應(yīng)用到育種當(dāng)中，相關(guān)開(kāi)發(fā)軟件也已被同行認(rèn)可和應(yīng)用。

據(jù)孫效文介紹，該成果從群體遺傳學(xué)應(yīng)用角度，實(shí)現(xiàn)了基礎(chǔ)研究與應(yīng)用研究的結(jié)合，為實(shí)現(xiàn)基因組水平的水產(chǎn)育種產(chǎn)業(yè)化奠定了基礎(chǔ)。

將基因和性狀關(guān)系的研究結(jié)果應(yīng)用于育種研究，主要包括三個(gè)階段：一是基于親本間遺傳關(guān)系，避免近親交配為主要目標(biāo)的分子水平育種；二是基于經(jīng)濟(jì)性狀和基因之間相互關(guān)系，尤其是經(jīng)濟(jì)性狀的數(shù)量性狀位點(diǎn)研究結(jié)果和功能基因組研究結(jié)果進(jìn)行分子育種；三是基于全基因組信息的經(jīng)濟(jì)性狀與基因相互關(guān)系的分子育種，尤其是對(duì)重要經(jīng)濟(jì)性狀如品質(zhì)性狀（肌間刺、氨基酸代謝等）的關(guān)鍵基因及信號(hào)通路的研究結(jié)果，以及進(jìn)一步的群體基因組學(xué)研究結(jié)果。

水產(chǎn)生物人才匱乏亟待重視

談及中國(guó)水產(chǎn)行業(yè)未來(lái)的發(fā)展，孫效文說(shuō)：“項(xiàng)目進(jìn)行中遇到的主要困難就是優(yōu)秀人才的流失和缺乏，這也是目前中國(guó)與歐美發(fā)達(dá)國(guó)家研究領(lǐng)域的主要差別，尤其是水產(chǎn)行業(yè)的基因組研究和生物信息學(xué)方面的人才，目前國(guó)內(nèi)仍處于極度缺乏的狀態(tài)�！�
美國(guó)相關(guān)研究開(kāi)展較早，從事基因組研究的人才隊(duì)伍龐大，且人員流動(dòng)和交流相對(duì)容易和頻繁，只要有好的研究平臺(tái)和待遇，不難吸引到優(yōu)秀的人才，而我國(guó)基因組研究人才整體匱乏，由于體制和待遇等原因，能夠分流到水產(chǎn)生物基因組研究領(lǐng)域的人才則更加稀少。
孫效文表示，中國(guó)水產(chǎn)生物的基因組研究也有自己的優(yōu)勢(shì)，比如中國(guó)的鯉魚(yú)養(yǎng)殖有幾千年的歷史，長(zhǎng)期的自然分化和人工選育使得中國(guó)的鯉魚(yú)種質(zhì)資源豐富度為世界之最。

中國(guó)水產(chǎn)業(yè)對(duì)基因組研究技術(shù)的需求度極高，尤其是淡水主要養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)具有肌間刺、肉質(zhì)等品質(zhì)方面的不足，這些性狀的改良十分依賴相關(guān)的基因組研究結(jié)果。

此外，中國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)量世界第一，占全世界的70%，這種巨大的市場(chǎng)需求也是基因組研究快速發(fā)展的重要?jiǎng)恿Α?BR>目前，該項(xiàng)目正在集中力量，從基因組水平對(duì)優(yōu)良品種和優(yōu)良地理種群進(jìn)行種質(zhì)評(píng)估，以期在群體基因組水平上提供下一步分子育種所必需的實(shí)用性強(qiáng)的基因資源和標(biāo)記。

同時(shí)，研究人員也在對(duì)鯉品質(zhì)性狀（肌間刺、脂肪發(fā)生、氨基酸代謝與合成）的關(guān)鍵基因及信號(hào)通路進(jìn)行解析與闡述，以期在基因組水平上開(kāi)展鯉的經(jīng)濟(jì)性狀全面家養(yǎng)化培育研究。

《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 (2012-04-24 B2 生物)